Original
December 2024, Vol. 37(6): 438-526
Metrics
28
Views
Share
Share
Abstract (EN)
Objective. To date, no data exist regarding the prevalence of integrase inhibitor (INSTI) resistance-associated mutations (HIVDRM) in HIV-infected pregnant women (HPW) in Latin America. We describe the prevalence and transmissibility of integrase HIVDRM in a historical cohort of INSTI-naïve HPW from Argentina (n=56) with Next Generation Sequencing (NGS).
Material and methods. Bioinformatics analysis was performed by HyDRA software for 20%, 10%, 5%, 2%, and 1% sensitivity thresholds. We calculated the mutational viral load for each INSTI-HIVDRM, considering those with >1000 c/mL as of high risk of transmissibility.
Results. The predominant HIV subtype was BF (78.5%). Major HIVDRM were not detected with the population sequencing 20% filter. With a 1% threshold, the prevalence increased to 8.9%; Y143C/S, E92G, E138K, and T66I mutations were found. The median (range) mutational load (expressed in c/mL) was: 355 (50.2-11705); with only 1 case >1000 c/mL Accessory mutations (G163R/K, T97A) were detected mostly with a 20% sensitivity threshold with an overall prevalence of 23.2%; the median (IQR) mutational load was: 23929 (4009-63158) c/mL; all of them above 1000 c/mL.
Conclusion. Our results show evidence of the presence of major INSTI-HIVDRM as aleatory mutations and a high frequency of accessory mutations with potential transmissibility in HPW.
Abstract (ES)
Objetivo. Hasta la fecha, no existen datos sobre la prevalencia de mutaciones asociadas a la resistencia (HIVDRM) a los inhibidores de la integrasa (INSTI) en mujeres embarazadas infectadas por VIH (HPW) en América Latina. Describimos la prevalencia y la transmisibilidad de las HIVDRM de la integrasa en una cohorte histórica de HPW naive de INSTI de Argentina (n=56) mediante Next Generation Sequencing (NGS).
Material y métodos. Se realizó un análisis bioinformático mediante el software HyDRA para umbrales de sensibilidad del 20%, 10%, 5%, 2% y 1%. Calculamos la carga viral mutacional para cada INSTI-HIVDRM, considerando aquellas con >1000 c/mL como de alto riesgo de transmisibilidad.
Resultados. El subtipo de VIH predominante fue BF (78,5%). No se detectaron HIVDRM principales con el filtro de secuenciación poblacional del 20%. Con un umbral del 1%, la prevalencia aumentó al 8,9%; se encontraron las mutaciones Y143C/S, E92G, E138K y T66I. La mediana (rango) de la carga mutacional (expresada en c/mL) fue: 355 (50,2-11705); con solo 1 caso >1000 c/mL. Las mutaciones accesorias (G163R/K,T97A) se detectaron principalmente con un umbral de sensibilidad del 20%, con una prevalencia general del 23,2%; la mediana (RIQ) de la carga mutacional fue: 23929 (4009-63158) c/mL;todas ellas por encima de 1000 c/mL.
Conclusión. Nuestros resultados muestran evidencia de la presencia de INSTI-HIVDRM principales como mutaciones aleatorias y una alta frecuencia de mutaciones accesorias con potencial transmisibilidad en HPW.
Explore
Articles
Volumes
About the journal
Most read
Revista Española de Quimioterapia
Revista Española de Quimioterapia
Revista Española de Quimioterapia
Revista Española de Quimioterapia
Revista Española de Quimioterapia